別ウインドウでEvernoteのノートを開いている状態で、Evernote for Windowsのアップデートをすると、ノートの内容が消えるバグがあるようです。
経緯
2012年10月28日の14：15ごろに、バージョン4.5.10.7422のマイナーアップデートの告知が来ました。
そのときは下の画像のように、2枚のノートを本体から切り離して別ウインドウで表示している状態でした（実際はタイトルや本文が書かれていました）。
この状態のままアップデートしました。インストールが終わってEvernoteを開くと、別ウインドウで開いていたノート2枚の内容が全て消えて、白紙になってしまいました。
ノートのタイトルとタグだけはそのまま残っています。ちなみにWindows版だけでなく、Evernote Webでも同じ状態です。
最後に
おそらくバグだと思いますが、これといった解決策はなさそうです。
Evernoteのアップデートするときは、必ず別ウインドウで開いているノートを閉じてから行うようにしてください。